1、1995年8月8日－10日，全国民航科技大会在京召开，结算中心被授予“民航科技工作先进集体”。

2、1997年5月7日，全国创建青年文明号活动组委会命名表彰1996年度“全国青年文明号”，中心海外业务部获此殊荣。

3、1997年12月26日，结算中心研发的“中国民航收入管理计算机系统”（SARAS/CAAC）荣获国家科技进步二等奖，总经理马铁生代表结算中心参加了在人民大会堂举行的颁奖仪式，并受到党和国家领导人的亲切接见。

4、1999年11月7日，结算中心研发的“中国民航国内邮件运输收入管理系统”通过中国民航总局组织的技术鉴定和验收,该系统荣获1999年民航总局科技进步二等奖。

5、2000年12月，结算中心海外业务部获得ISO9002质量体系认证书和UKAS（英国皇家认证认可委员会）国际标准认证书。

6、2001年“中国民航国内收入管理系统”荣获民航科学技术一等奖。

7、2002年“中国民航SPA自动分摊系统”荣获民航科学技术一等奖。“中国民航收入结算系统主机资源管理及性能优化”、“中国民航分布式销售管理系统”、“中国民航国内货运收入管理系统”荣获民航科学技术二等奖。

8、2003年8月28日，结算中心正式获得美国软件工程研究所（SEI）授予的企业级CMM二级资格证书，成为中国民航业的第一个跨入国际软件市场门槛的企业。

9、2004年5月，结算中心海外业务BSP数据处理中心荣获“全国青年文明”荣誉称号。

10、2004年5月18日，结算中心获得了“北京市软件企业认定证书”，编号为：京R-2004-0122。标志着中心开发自主知识产权软件产品的能力得到了市场的认可，并得到了国家相关优惠政策的支持。

11、2005年三八节前夕，海外部澳航客运结算室荣获全国民航工会授予“2004年度民航系统女职工建功立业示范岗”称号。

12、2005年5月，国内业务部客运审核科获得 “全国青年文明号”荣誉称号。
　
13、2005年“民用航空信息系统安全等级保护管理规范”、“民用航空信息系统灾难备份与恢复管理规范”、“民航信息系统风险评估实施办法试点研究”荣获民航科学技术三等奖。

14、2006年1月，结算中心BSP数据处理业务获IATA2005年度审计A评定。ACCA所获得的A级认定是迄今为止IATA历史上最高的记录，并且是全球所有BSP数据处理服务提供商中唯一A级的获得者。

   
15、2006海外部澳航客运结算室获得了由中华全国总工会授予的“2005年度女职工建功立业标兵岗”称号。

16、2007年5月18日，系统服务部系统服务室被中国民航总局和共青团中央授予“全国青年文明号”光荣称号。