国内清算系统是为国内清算网提供清算服务的系统，由ACCA依据国际航协清算所制定的标准设计开发，2003年通过美国SEI的CMM二级评审。该系统通过搜集整理联运开账数据、帐单审核、系统轧差、生成收付款余额通知单、清算等环节完成清算工作。

    国内清算系统使航空公司之间的双边联运清算变为多边清算，保证了航空公司的联运收入在最短的时限内得以实现，减少了资金的在途时间，并为国内清算工作电子化、系统化管理发挥了重要的作用。